随着金宝贝微生物菌肥对各种农作物抗病、抗重茬效果明显，增产幅度大（经济作物增产在30%以上，大田作物增产10%以上）的趋势下。越来越多的菜农认识到生物菌肥在蔬菜、作物生产上的重要性。于是，生产中很多菜农表现出了过分地依赖和使用菌肥的情况，并逐渐进入使用误区，其主要表现在以下三方面：
一、菌肥能与化肥混施吗？
有些菜农认为，菌肥不能与化学肥料混用。混用后，高浓度的化学物质就会杀灭菌肥中的活性菌，因而致使菌肥失去效果。殊不知菌肥中养分含量很少，单独使用很难满足作物生长需求。菌肥可与化肥混合使用，如过磷酸钙等施入土壤后易被固定，与生物有机肥混合施用，可减少养分固定、流失。而且单独施用较大量的化肥或化肥施用不均匀时，容易对作物产生毒副作用，如果与菌肥混合施用，则会减少此类问题发生。
二、菌肥施用越多越好吗？
土壤中施入较多的菌肥，虽然不会出现烧根烧苗现象，但也并不是施得越多就越好。盲目大量施用生物菌肥，虽然不会向化学肥料那样造成蔬菜烧根死苗，但是蔬菜植株体内盐类积累增加，有害消费者的身体健康，恶化土壤质地，增加了肥料投入成本（因为生物菌肥价格较高），降低蔬菜的栽培效益。因此，应根据不同作物的需要和土壤养分状况，科学地确定生物菌肥施肥量，才能达到增产增收的目的。
三、满足生物菌肥肥效发挥条件重要吗？
金宝贝生物菌肥内含有大量的土壤益生微生物，这些微生物能够释放土壤中的不可溶性磷钾等肥料元素，施用后增效显著。但是，这类微生物多是好气性菌类，它们的一切生命活动，都需要适宜的温度、水分和适量的氧气。因此，必须在高温焖室以后才能施用，以免焖室时因土温高，使之失去活力。并且微生物菌肥要浅施，入土深度5～8厘米为好，不可深于10厘米，防止深层土壤氧气不足，影响微生物的活性，降低使用效果。
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